La Plataforma de Bioinformática ofrece soporte en esta segunda etapa, proveyendo diferentes programas y espacio físico en servidores propios a los investigadores que así lo requieran. Se realizará el mapeo en los genomas de referencia, los controles de calidad de los alineamientos obtenidos y se llevará a cabo la identificación, cuantificación de los transcritos e isoformas, y la normalización de los datos. Finalmente, se analizará la expresión diferencial en RNA-seq. Si bien estos análisis estadísticos son diferentes a los utilizados en microarrays de expresión, tienen las mismas bases conceptuales y similares desafíos. Por eso la Plataforma de Bioinformática del IDIBAPS, con una vasta experiencia en el análisis de microarrays, se encuentra en una situación privilegiada para adaptarse a las nuevas tecnologías.
