El IDIBAPS fue uno de los cinco primeros Institutos de Investigación Sanitaria (IIS) acreditados por el ISCIII a principios de 2009. Actualmente ya son 22 los IIS acreditados en todo el estado Español. La normativa de los IES obliga a una evaluación periódica, cada 5 años, del funcionamiento y los resultados del IIS. El IDIBAPS ha alcanzado satisfactoria y positivamente esta re-acreditación, con comentarios muy positivos del equipo evaluador.
La acreditación de los centros de investigación como Institutos de Investigación Sanitaria (IIS) fue una iniciativa del ISCIII con el fin de estructurar de manera más adecuada las actividades y los grupos de investigación biomédica de excelencia de la entorno del Sistema Nacional de Salud. El requisito imprescindible para ser acreditado como IIS es la existencia de un espacio físico propio en el contexto hospitalario, destinado a la investigación, donde se produzca la integración e interacción de los grupos de investigación provenientes del propio hospital, de la universidad y / o de otros centros de investigación públicos o privados.
