Ser acreditat indica que "es tracta d'una institució on es realitza recerca d'excel·lència sobre el càncer amb una excel·lent gestió institucional com a suport clau per a la recerca". A més d'un segell de qualitat, l'acreditació ofereix un finançament basal per part de la Fundació Científica i permet accedir a convocatòries exclusives per a centres amb aquest distintiu.
L'IDIBAPS va participar en el primer Programa Centres Fundació el 2019. Ara ha renovat la seva participació en l'acreditació per quatre anys més, fins a finals de 2028. És un dels 13 centres acreditats per la Fundació Científica que hi ha actualment a Espanya.
El suport de la Fundació Científica a la recerca de l'IDIBAPS ha estat i continua sent molt important. Per exemple, només el 2024, la Fundació Científica va concedir més de 10 milions d'euros a projectes de recerca contra el càncer liderats per l'IDIBAPS. Així mateix, ambdues institucions col·laboren en altres iniciatives com visites a les instal·lacions de l'IDIBAPS per a persones treballadores, voluntàries o pacients de l'Associació.