Un equip internacional d’investigadors ha completat el mapa dels canvis genètics en la leucèmia limfàtica crònica (LLC). Aquesta eina proporcionarà una millor comprensió de la malaltia i pot conduir a pronòstics més precisos per als pacients, diagnòstics millorats i al desenvolupament de nous tractaments.
El treball es publica a la revista Nature Genetics i està coordinat per investigadors de l'IDIBAPS-Hospital Clínic i la Universitat de Barcelona, la Universitat d’Oviedo, tots ells del CIBERONC; el Dana-Farber Cancer Institute i el Broad Institute del MIT i Harvard University, de Boston; i la Ulm University d’Alemania.
La leucèmia limfàtica crònica (LLC) és un tipus de càncer de la sang i és el tipus de leucèmia més freqüent en el món occidental, amb una incidència al voltant dels 5 casos per cada 100.000 habitants i any. Es caracteritza per un augment en el nombre de limfòcits B, un tipus de glòbul blanc, que es pot detectar de forma accidental en una analítica rutinària.
La LLC pot tenir un creixement lent i de bon pronòstic, o ràpid i agressiu. El coneixement de les alteracions moleculars que provoquen aquesta evolució tan diferent podria permetre conèixer el pronòstic de manera precoç. Estudis previs havien proporcionat fragments d'un mapa de la LLC, cadascun centrat en tipus particular de pacients o amb dades limitades. “L’objectiu d’aquest estudi ha estat proporcionar un catàleg pràcticament complert de totes les alteracions genòmiques que causen la LLC i els seus subtipus moleculars. Ha estat un esforç immens d’un gran equip internacional que ha analitzat el genoma de més de 1000 pacients utilitzant noves eines bioinformàtiques durant més de 4 anys”, assenyala Elias Campo, coautor principal de l’estudi, cap del grup Patología molecular de les neoplàsies limfoides de l’IDIBAPS i investigador del CIBERONC.
Més de cent nous gens implicats en l’aparició de la malaltia
Per construir el mapa de la LLC, els investigadors van analitzar les variacions en les seqüències genètiques, els patrons d'expressió gènica i les modificacions químiques de l'ADN (dades genòmiques, transcriptòmiques i epigenòmiques) de 1.148 pacients.
En l’estudi s’han identificat 202 gens (109 dels quals eren nous) que, quan estan mutats i poden conduir a l’aparició i progressió de la malaltia. També s’ha perfeccionat la caracterització dels subtipus d’aquesta leucèmia, que es diferencien en les seves característiques genòmiques i la seva evolució clínica. “Més enllà de les seqüències genètiques, els patrons d'expressió de certs gens ens han permès fer una subcategorització de la malaltia, que proporciona informació pronòstica molt valuosa”, explica Xose S. Puente, investigador de l’Institut Universitari d’Oncologia de la Universitat d’Oviedo i del CIBERONC i coautor principal de l’estudi.
Els resultats clínics dels pacients es van associar a les característiques genòmiques, transcriptòmiques i epigenòmiques del seu tumor, de manera que la integració d'aquestes dades pot predir la probabilitat d'un pacient de tenir una malaltia molt indolent durant molts anys, experimentar una remissió després del tractament o la possibilitat que la seva leucèmia sigui més agressiva i requereixi nous tractaments.
Els resultats d’aquest estudi poden tenir un important impacte en la pràctica clínica, ja que, “el nou mapa ens permetrà comparar les característiques genòmiques dels nous pacients amb les dades de pacients amb perfils genètics similars i conèixer quina ha estat la seva evolució i resposta als tractaments", explica Iñaki Martín-Subero, coautor principal de l’estudi, cap del grup Epigenòmica biomèdica de l’IDIBAPS i investigador del CIBERONC.
Una eina oberta a la recerca
Un dels objectius de l’estudi és que aquesta informació pugui ser aprofitada per la comunitat científica per tal d’avançar en el tractament d’aquesta malaltia. Per això, el mapa identificat en aquest estudi s’ha transformat en un portal web interactiu perquè els investigadors d’arreu del món el puguin utilitzar com a recurs en la seva recerca i puguin avançar en el coneixement de les causes i característiques dels diferents subtipus de LLC.
"El nou mapa de la LLC ens permet avançar cap a la medicina de precisió en aquesta malaltia, ja que ens pot ajudar a adaptar amb més precisió el pronòstic i el tractament d'un pacient nou en funció de les seves característiques moleculars particulars”, conclou Elias Campo.
L'estudi també ha estat liderat per Gad Getz, del Broad Institute del MIT; Catherine Wu, del Dana-Farber Cancer Institute i la Harvard Medical School; i Stephan Stilgenbauer, de la Universitat d'Ulm d'Alemanya.
Els primers coautors de l’estudi són Ferran Nadeu i Martí Duran-Ferrer, de l’IDIBAPS i el CIBERONC: Binyamin A. Knisbacher, Broad Institute del MIT: Ziao Lin, de Harvard; i Cynthia K. Hahn, del Dana-Farber Cancer Institute i el Broad Institute del MIT.
Aquest treball ha estat possible gràcies al finançament de la Fundació La Caixa, i dels National Institutes of Health (NIH) i del Broad/IBM Resistance Research Project, amb el suport del CIBERONC.
Referència de l’estudi
Molecular map of chronic lymphocytic leukemia and its impact on oBinyamin A. Knisbacher, Ziao Lin, Cynthia K. Hahn, Ferran Nadeu, Martí Duran-Ferrer, Kristen E. Stevenson, Eugen Tausch, Julio Delgado, Alex Barbera-Mourelle, Amaro Taylor-Weiner, Pablo Bousquets-Muñoz, Ander Diaz-Navarro, Andrew Dunford, Shankara Anand, Helene Kretzmer, Jesus Gutierrez-Abril, Sara López-Tamargo, Stacey M. Fernandes, Clare Sun, Mariela Sivina, Laura Z. Rassenti, Christof Schneider, Shuqiang Li, Laxmi Parida, Alexander Meissner, François Aguet, Jan A. Burger, Adrian Wiestner, Thomas J. Kipps, Jennifer R. Brown, Michael Hallek, Chip Stewart, Donna S. Neuberg, José I. Martín-Subero, Xose S. Puente, Stephan Stilgenbauer, Catherine J. Wu, Elias Campo & Gad Getzutcome Molecular map of chronic lymphocytic leukemia and its impact on outcome Nat Genet (2022). https://doi.org/10.1038/s41588-022-01140-w
