Anàlisi funcional de neopèptids de canvi de patró de lectura en síndrome de Lynch

OBJECTIUS: El desenvolupament de la immunoteràpia és una de les revolucions en el tractament del càncer. La síndrome de Lynch (SL) és la forma més freqüent de càncer hereditari amb un risc elevat de càncer colorectal i endometri, entre altres. L'SL és un model ideal per al desenvolupament de vacunes contra el càncer perquè els tumors comparteixen mutacions que generen neopèptids de canvi de patró de lectura (anomenats FSDN en anglès) que són predictibles. El nostre grup ha identificat un conjunt de neopèptids específics del SL que seran la base d'un assaig clínic fase I avaluant l'eficàcia i seguretat d'una vacuna basada en cèl·lules dendrítiques carregades amb aquests neopèptids. No obstant això, és fonamental generar més evidència experimental sobre el seu paper en la inducció d'una resposta T citotòxica, que és la principal resposta antitumoral.

El present projecte té com a objectius: 1) Avaluar in vitro la capacitat d'inducció de citotoxicitat dels FSDN prioritzats en individus amb síndrome de Lynch; i 2) Avaluar si els FSDN prioritzats podrien tenir un paper en el desenvolupament d'immunoteràpia per a una mena de càncer colorectal no hereditari que comparteix la via de carcinogènesi amb la síndrome de Lynch.

MÈTODES: Objectiu 1: Es crearà un model in vitro basat en organòides col·lorectals que expressin els FSDN prioritzats en els quals s'avaluarà la resposta citotòxica dels limfòcits T autòlegs estimulats amb cèl·lules dendrítiques. Objectiu 2: S'avaluarà la presència dels FSDN prioritzats en els càncers colorectals amb inactivació esporàdica dels gens reparadors de l'ADN mitjançant eines bioinformàtiques i seqüenciació de tumors.