El Programa de Neuroimmunologia focalitza els seus esforços en l'estudi del diagnòstic precoç d'aquestes malalties i el disseny de teràpies més efectives per al seu tractament. Patologies com l'Esclerosi Múltiple suposen un gran problema social perquè afecten persones joves que, sense un diagnòstic i un tractament adequats, podrien veure limitada una part important de la seva vida productiva. Altres malalties com les encefalitis autoimmunes, descobertes, descrites i en molts casos curades per representants d'aquest programa, són malalties invalidants que es poden revertir completament amb un diagnòstic oportú.
Per seguir aconseguint avenços d'aquest tipus, quatre equips de recerca consolidats liderats per doctors de l'Hospital Clínic i investigadors del IDIBAPS uneixen els esforços en el nou Programa. Les línies principals de recerca que treballen conjuntament, i en col•laboració amb centres internacionals, són:
- Immunopatogènesi de les Malalties Neurològiques paraneoplàsiques PI: Dr Francesc Graus, Cap del Servei de Neurologia de l'Hospital Clínic.
- Autoimmunitat sobre Antígens sinàptics PI: Dr Josep Dalmau, Professor ICREA a l'IDIBAPS.
- Esclerosi Múltiple, Patogènesi i Noves Teràpies PI: Dr Pablo Villoslada, neuròleg i investigador de l'IDIBAPS.
- Marcadors Biològics i de neuroimatge en Esclerosi Múltiple i Neuromielitis Òptica PI: Albert Saiz, neuròleg del Servei de Neurologia de l'Hospital Clínic.